对于学科建设，作为一个综合性的师范类院校，曲师大做的还是很不错的。

截至2013年9月，曲阜师范大学有博士后流动站5个，博士学位一级学科授权点5个，涵盖31个二级学科博士点，另有单独设立的博士二级学科授权点2个，有硕士学位一级学科授权点22个，涵盖114个二级学科硕士点，另有单独设立的硕士二级学科授权点9个，还有硕士专业学位授权点10个。学校有山东省“十二五”重点学科18个，其中省级特色重点学科7个。

博士后流动站
数学、体育学、中国语言文学、历史学、物理学。
博士学位一级学科授权点
中国语言文学、中国史、数学、统计学、物理学。
硕士学位一级学科授权点
教育学、中国语言文学、马克思主义理论、中国史、外国语言文学、心理学、美术学、音乐与舞蹈学、体育学、统计学、地理学、数学、物理学、电子科学与技术、化学、戏剧与影视学、计算机科学与技术、软件工程、生物学、生态学、系统科学、控制科学与工程。
山东省“十二五”重点学科
运筹学与控制论（特色）、光学（特色）、专门史（特色）、外国语言学及应用语言学（特色）、中国古代文学（特色）、野生动植物保护与利用（特色）、应用数学（特色）、体育人文社会学、中共党史、基础数学、物理化学、理论物理、人文地理学、成人教育学、汉语国际教育、应用心理学、中国现当代文学、政治经济学。

教学建设

质量工程
截至2014年6月，曲阜师范大学有国家级特色专业6个，国家级专业综合改革试点专业1个，省级品牌特色专业18个，省级精品课程35门，省级双语示范课程1门，省级实验教学示范中心4个。
国家级特色专业
汉语言文学、数学与应用数学、教育学、物理学、体育教育、历史学。
国家级专业综合改革试点专业
生物科学。
省级品牌特色专业
汉语言文学、历史学、英语、教育学、数学与应用数学、统计学、物理学、光电信息科学与工程、化学、生物科学、体育教育、公共事业管理（体育）、教育技术学、地理科学、思想政治教育、自动化、网络工程、工商管理。
省级实验教学示范中心
生物学实验教学示范中心、化学实验教学示范中心、数字媒体与传播技术实验教学示范中心、物理实验教学中心。
省级精品课程
基础物理实验、Visual FoxPro程序设计、思想道德修养与法律基础、英语语言学概论、学习科学与教育技术、中华人民共和国史、法学概论、运筹学、Visual C 程序设计、古代汉语、教育心理学、物理教学论、学校体育学、中国古代史、软件工程、Visual Basic程序设计、有机化学、物理化学、中国现当代文学、计算机辅助教育、信息化教学理论与方法、化学教学论、数学教学论、篮球、数学分析、体育管理学、网球、足球、社会调查研究方法、化学实验教学研究、有机化学实验、物理化学实验、无机化学实验、分析化学（含仪器分析）实验、民法学。
教学成果

截至2013年9月，曲阜师范大学在第一至四届全国大学生数学竞赛中连续获得一等奖，学生考研率一直保持在30%以上，部分专业高达67%以上；英语专业八级通过率高达75%，高出全国平均通过率30余个百分点；法学专业司法考试通过率达到42%。2006年至2012年间，学校学生参加全国全省各类大赛获奖1792项。2012年，教育部公布了度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目名单，其中曲师大学生主持的项目35个，包括创新训练项目27个，创业训练项目8个，曲师大是教育部批准的山东省首批有资格立项国家级大学生创新创业项目的11所省属高校之一。