瓮安县境内野生动植物资源种类繁多，具有较大的棕合开发价值。有植物近800种，蕨类、藻类、菌类、苔鲜和种子植物80多科400多种，被子植物70多科400多种。 生长着红豆杉、银杏、楠竹、香果树等珍贵树种，盛产天麻、杜仲、竹荪、金银花、龙胆草、锁阳、天门冬、靡香等400余种中草药和名责中药材。有动物400多种，野生脊椎动物202种。栖息着斑玲、苏门玲、牛小灵猫、红腹锦鸡、大鲵、猕猴、大锐、虎纹蛙、林麝等国家保护动物。

　　植被：县境植被分属亚热带常绿阔叶林植被带，有林地面积达到6.5万公顷，森林覆盖率达到45%，林木活立木蓄积量达到246.6万立方米。原生植被朱家山林区保存较为完好，其余多是次生的各类暖性针叶林、灌木林、灌草丛。有以斑竹、水竹、慈竹、刺竹和极少数的罗汉竹等禾本科竹亚科成片竹子或竹类与阔叶树种、针叶树种所混生。境内朱家山自然风景区处处峰连叠嶂，茂林密布，飞瀑流泻，鸟语花香，溪水回还，异兽珍禽，具备较好的旅游开发价值。

　　野生植物：县内野生植物资源种类繁多，具备较好的种、养、加综合开发价值。主要有刺梨、狲猴桃、鱼腥草、板栗、茅栗、蕨菜、百合、葛藤、山楂、青皮梧桐、竹叶椒、油菜、桂花、乌桕、刺槐、黄荆、漆树、悬钩子、云实、穗木、柿树、蔷薇、胡枝子、香椿、威菜、山葱、紫菌、奶浆菌、冻菌、茅草菌、木耳、香菇、荞把菌、青冈菌、刷把菌、松树菌等。

　　药用植物：主要有天麻、杜仲、川穹、升麻、丹参、土伏苓、天冬、桂皮、桑皮、黄桕、 桑寄生、灵芝菌、艾蒿、夜寒苏、天南星、牛膝、白术、白芍、半夏、龙胆、麦冬、赤苟、何首乌、羌活、党参、桔梗、苍术、藕节、续断、女贞子、白果、乌梅、鹿麻子、大金银花、山罗卜、马鞭草、千里光、无花果、岩黄连、金钱草、调经草、蒲公英、淫羊霍等。

　　工业用植物：有油桐、香椿、白花泡桐、紫花泡桐、香樟、楠木、枫树、桦木、女贞、龙须草、水麻、板栗、丝栗、枫香、核桃、漆树、猴樟、野八角、桂花、乌桕、漆树、蔑麻、算盘子、野菜莉等。

　　草场：全县有各类天然草场65万亩， 300亩以上的连片草场98个。野生牧草有20科87种，其中禾本科25种，有白菜、野青菜、东草、狗尾草、草木樨、百脉根、鸡眼草、园叶舞草、山蚂横、马兰、野菊花、朝天罐、富菜、莎草等，以及毛瓦科、茜草科、蔷薇科、伞形科、百合科、旋花科、唇形科、三白草科、野牡丹科、桑科、水龙骨科、山萝卡科、龙胆草科、车前草科等。具备较好的畜牧养殖综合开发价值。

　　动物：鱼类57种，分属4目9科。有花蜡、铜鱼、青鱼、鳝鱼 乌鲤 、七星鱼 、土徐、南方大口给虾、蟹等。两栖类动物8种，分属2目5科。有大锐、虎纹蛙等国家保护动物。爬行类动物共19种，分属3目7科。有龟、鳖、蛇。鸟类动物共70种，分属13目26科。有白鹏、红腹锦鸡、雀鹰、金雕、 莺，属国家保护动物及环颈维、长尾维、红腹锦鸡、事鸟享鸟、竹鸡、麻斑鸡、珠项斑 鸡、灰斑鸡、大雁、兔、黄鸭、大眼照、麻雀等。哺乳类动物共48种，分属7目11科。有中斑玲、苏门玲、短毛猴、狂草猴、水猢、穿山甲、豹猫、大灵猫、小灵猫、刺猪、属国家保护动物。及狐、豹猫、黄融、香刷、络、水搬、呆子狸、小鹿、刺 扁、草兔、山兔、竹鹉、狲猴等。