1998年学校与高中部脱钩独立办学，恢复1934年原校名——台州初级中学，学校租赁原台州军分区办学，先后筹资8300多万元，以原台州军分区为据点，先后并购了临海市消防器材厂、台州市体委、临海市青少年宫等五家土地，先后建造了西教学楼、东教学楼、食堂、体育馆、科技馆、学生公寓等，配备一流的教学设备。2002年学校被确认为浙江省首批城镇示范初中，学校实施“中学生素质拓展计划”，开始走特色办学道路。2003年学校筹资在临海城东洛河创办国有民办学校——台州学院附属中学，两校共同组成台初教育集团。2007年学校与台州中学、临海市第二职成教中心三所学校实行教育资源整合，学校把洛河新校区置换给市第二职成教中心。台州中学把老校区置换给台州初级中学。2007年，台州中学搬迁到新校区，至此，台初教育集团的两所学校开始在自己公寓等，配备一流的教学设备。2002年学校被确认为浙江省首批城镇示范初中，学校实施“中学生素质拓展计划”，开始走特色办学道路。2003年学校筹资在临海城东洛河创办国有民办学校——台州学院附属中学，两校共同组成台初教育集团。2007年学校与台州中学、临海市第二职成教中心三所学校实行教育资源整合，学校把洛河新校区置换给市第二职成教中心。台州中学把老校区置换给台州初级中学。2007年，台州中学搬迁到新校区，至此，台初教育集团的两所学校开始在自独立校园办学。2012年，国有民办学校改制，台州学院附属中学改制为民办学校。