一、县卫生局
本县卫生管理机构始设于民国23年(1934)。是时，县政府设卫生助理员，佐理地方卫生行政事务，若遇疫疠发生，即专门担任防疫事宜。
建国初，卫生工作由县人民政府三科（教育科）管理。1955年5月，分设卫生科。1957年9月，教育、卫生合并为教育科。1961年9月，教育科改为文（化）教（育）卫生局。1968年8月，卫生工作由县革命委员会生产组综合组管理。1970年12月县革命委员会成立卫生局。1972年，恢复文教卫生局。1978年4月，分设卫生局。至1990年，局内设政办、业务、财务3个股室，编制干部12人；下辖县卫生防疫站，药品检验所及各医疗单位。
二、中共合阳县委地方病防治领导小组
1973年9月20日，成立中共合阳县委地方病防治领导小组，县委副书记兼任组长，下设办公室处理日常事务。县卫生防疫站承担地方病防治业务。
三、县爱国卫生运动委员会
1952年8月，成立合阳县防疫委员会，后改为爱国卫生运动委员会，主任由副县长兼任，下设办公室（先归县医院，1972年后归县防疫站），1984年列为县政府序列部门，编制干部5人，专管全县的爱国卫生工作。
四、县公费医疗委员会
1952年10月，县政府成立合阳县公费医疗委员会，下设专职干部1人，编制在卫生局，具体办理公费医疗业务。

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