1. 六朝博物馆 已开工建设，2014年建成并对外开放。(牵头市领导：郑泽光，责任单位：市文广新局)
2. 中国科举博物馆 结合夫子庙地区整体改造，建设中国科举博物馆及配套设施。2012年完成论证和规划，启动搬迁工作。2014年6月前基本建成。(牵头市领导：郑泽光、许仲梓、陆冰，责任单位：秦淮区政府、南部新城指挥部、市文化集团、市卫生局、市规划局、市文广新局)
3. 孙权展示馆 2012年开工建设，2014年6月底前基本建成。(牵头市领导：陈刚，责任单位：中山陵园管理局、市规划局)
4. 南京明城垣史博物馆新馆 2012年底前完成项目选址和规划设计，2014年青奥会前建成。(牵头市领导：郑泽光，责任单位：市文广新局、市规划局、市国土局)
5. 江宁织造府博物馆(云锦博物馆) 继续加紧征集文物和资料，力争2012年底前完成陈列布展并对外开放。(牵头市领导：陈绍泽、陆冰，责任单位：市城建集团、市文广新局)
6. 太平天国壁画艺术馆 完成堂子街太平天国壁画抢修性保护、搬迁住户、综合整治周边环境，力争2012年建成开放。(牵头市领导：郑泽光、陆冰，责任单位：市住建委、白下区政府、市文广新局)
7. 南朝石刻博物馆 以新合村六朝石刻群为中心，集中展示南京六朝石刻艺术。2012年完成设计方案，力争2013年建成。(牵头市领导：郑泽光，责任单位：栖霞区政府、市文广新局)
8. 陶行知纪念馆 2012年改造扩建陶行知墓区及配套设施，2014年青奥会前建成纪念馆。(牵头市领导：许仲梓，责任单位：南京晓庄学院、市教育局、栖霞区政府)
9. 南迁文物博物馆(暂名) 2012年启动南迁文物博物馆规划设计，力争2014年建成。(牵头市领导：陆冰，责任单位：河西指挥部、市规划局、市文广新局)
10. 东吴历史文化博物馆(暂名) 以上坊东吴大墓为基础，建设保护性设施和配套设施。2012年完成规划设计，2015年前建成并对外开放。(牵头市领导：周谦，责任单位：江宁区政府、市文广新局)
11. 南大标本与古化石博物馆 对南大历史建筑实施维护与修缮，在现地质实验楼所在地建设标本与古化石博物馆，2014年青奥会前建成。(牵头市领导：郑泽光，责任单位：南京大学、市文广新局)
12. 青奥博物馆 2012年完成设计方案，2014年建成。(牵头市领导：刘以安、徐锦辉，责任单位：青奥组委执委会、河西指挥部、市体育局、市文广新局)