浑源县水务局是全县水行政主管部门，主要职责是承担全县农村的抗旱防洪、饮水解困、水土流失治理及保护监督，水利重点工程的规划、设计、组织实施，并审批发放取水许可证等。水务局内设办公室、农水站、水保站、水利工程管理站、水保监督站、水政监察大队、抗旱队、防汛办、移民办。下属单位有恒山水库、神溪水库、王千庄灌区、凌云口灌区、节水办、水资办，各机构具体职能如下：
1、办公室：
协助局领导对各站室和所属单位工作进行综合协调，组织局机关日常工作；承办政务信息、文秘、档案、机要、宣传、信访及会议组织；承办局里交办的其它事项。
2、农水站：
负责全县农村小型农田水利工程的建设与管理；承办农村人畜饮水工程、井灌区、小型水库、万亩灌区、小型自流灌区、小型机电灌站、水产养殖及其它小型农田水利工程项目的规划、上报、组织实施和验收工作，加强工程资金管理；组织协调农村供水、节约用水、节水灌溉、水利社会化服务体系建设、小水改制等工作；负责农村人畜饮水工程的建后投用和运行管理；
3、 水保站
负责全县水土流失普查、监测和水土保持综合治理的规划编制及上报工作，承办水土保持综合治理工程项目的组织实施和工程验收，加强工程资金管理；组织协调水保工程治理成果的管护；
4、水利工程管理站
负责管理和保护全县河道、岸线、河堤，制定技术标准并监督实施；组织编制河道采砂、整治、建设规划；负责审批在河道管理范围内的项目建设方案，组织实施河道采砂许可制度；负责河道工程维护管理费和河道采砂管理费的征收；取缔河道人为设障，打击河道管理范围的违法活动；协助抗旱防汛队做好河道防汛工作；
5、 水保监督站
负责监督水土保持法律法规的贯彻落实，会同相关部门编制水土保持方案，对建设项目中涉及的水土保持方案进行审批并监督实施，对生产建设中人为造成的水土流失行为的单位和个人依法查处；负责对水土流失补偿费和治理费的征收；
6、 水政监察大队：
负责全县水利法律、法规宣传教育，保护水资源、水域、水工程、水土保持、生态环境、抗旱防汛和水事监测等相关设施与设备，对全县水事活动进行监督检查，维护正常的水事秩序，对水事案件实施行政查处，对水事纠纷进行调解、仲裁和组织听证；承办全县水行政诉讼、复议工作；协调监督水资源、水土保持、河道、渔政和节约用水执法工作，配合和协助公安和司法部门查处水事治安和刑事案件；
7、抗旱队、防汛办：
承担全县抗旱防汛指挥部的日常工作；负责协调全县中小河流、中小型水库、边山峪口的防汛工作；编制全县防汛预案，对全县防汛工作进行汛前、汛中、汛后检查，参与和做好全县的抗旱工作；编制抗旱防汛计划、筹备物资、收集灾情，及时上传下达，同时参与其它自然灾害的抗灾救灾工作；
8、水资办：
负责对全县水资源（含地表水、地下水、矿泉水、地热水、集蓄利用的雨水、城市中水、煤矿矿坑排水等）进行统一管理，统一调配，协调和解决用水矛盾；对全县水资源进行调查评价和综合规划，根据国民经济发展要求，研究水资源平衡和各阶段发展趋势，提出相应的建设措施，并及时发布水资源公报、简报；对全县国民经济总体规划、城市发展规划及建设项目进行水资源论证；制定全县水资源保护规划，划分水功能区，审定水域纳污能力和排污口的设置，提出限制排污总量的意见；组织实施全县取水许可制度和水资源费的征收管理，负责对取水许可证的审批、发放和换证工作，并协调全县水事工作；
9、节水办：
负责编制并组织实施县城节约用水规划和各类用水定额草案，开展县城节约用水宣传教育和调查研究工作；负责审批、制定和下达用水单位的节约用水计划，并考核其节约用水计划的执行情况，及时推广先进的节约用水技术和经验；负责对县城新建、扩建和改建工程中配套建设的节约用水设施的竣工验收；负责管理县城节约用水项目发展基金；
10、移民办：
负责全县库区移民工作；承办库区移民前期登记、审核、上报和补偿资金发放等工作；完成移民后期生产规划和扶助工作，使移民达到或超过原有生产、生活水平；
11、各灌区：
负责覆盖区农田灌溉和防洪抗涝工作；负责本灌区水库大坝（恒山水库灌区、神溪水库灌区）和灌区设施设备的安全保卫、除险加固、维修保养工程项目建设、安全生产等工作；