起源于中原汉族已经得到了来自历史学家、语言学研究、生物学、社会人类学、考古学发现以及成文家谱的支持，其翔实的历史史料为我们的遗传学研究提供了理想的线索。曾有专家指出潮汕人和中原汉族、华东汉族群体所特有的“六甲遗传”或为纯种汉人标志体征[13] 。
根据史料记载的入潮移民迁徙数量和潮汕地区历代人口变化情况推断，潮汕地区历史上第一次移民潮时间可能在秦末汉初，他们的构成主体是秦军；第三批大规模移民潮的涌入时
部分基因图谱
部分基因图谱(20张)
间在东汉末年至西晋末年间，这段历史与“衣冠南渡、八姓入闽”有关，这也是当今汉语各大方言中数潮州话最近魏晋官话之主因[14-15] 。往后的三次移民潮分别发生在唐末、宋末、元明，其中又以南宋末年和元末明初这两个时期的入潮数量为巨，其直接促成了潮州府的行政区划变革，对往后潮汕民系的形成起到了根本性的作用[16] 。另外，北宋之后的南迁移民由于多经福建莆田入潮[17] 。因此从某种程度上讲，当今潮汕人多数为莆田人后代，故有“潮汕人，莆田祖”一说[18-19] 。
然而，古时迁入潮州的移民又非只汉人一类，如“楚灭越后，越王勾践的子孙离散到今浙南、福建和粤东一带，分别建立了瓯越国和闽越国，其中闽越国的范围大致是福建和今粤东一带”[20] （勾践芈姓，其Y染色体已测出，确属颛顼一系，为汉人前身华夏族无疑[21] ）。其后，最迟于晋初便已入潮繁衍的疍家、隋唐时期南迁入潮的畲民、隋初又有少量僚壮经粤北入潮（两广除粤东以外均为僚壮根据地），只是这部分移民的数量远不如历代入潮的汉人总量，加之族群间的仇杀（如原住民俚人与西来僚壮的战争）、被迫迁离及散余汉化，故没能对潮汕民系的形成起太大影响。至当代，仅有少量畲民聚居于潮州凤凰山区[22-23] 。
海内外多所高校研究机构曾多次对广东三大汉族民系的遗传基因和体貌特征进行对比研究，其得出的结论基本一致，即广东客家人与广府人的相似性较大，这两个族群与广西壮族有较大的相似性；潮汕人与北方15省汉族群体的相似性较大。这表明，客家人和广府人与百越民族的融合程度较高，而潮汕人与百越民族的融合程度较低。此类研究重在寻求遗传基因方面的医学突破。（今日汉族在父系血统上基本一致，唯南北母系血统上有些许差别[24-25] ）