南京林业大学南方学院是1999年经江苏省教育厅批准，按照新机制、新模式举办的公有民办二级学院。学院坐落在风景秀丽的紫金山麓、碧波荡漾的玄武湖畔的南京林业大学校区内，学院教学设施齐全，生活环境优良。南方学院自1999年建院以来，秉承百年老校——南京林业大学优良的办学传统和先进的教育理念，依托南京林业大学优质的教学资源，独立组织教学，是南京林业大学本科生培养的有机组成部分。

2010年，淮安校区成立，学校将逐步搬迁至淮安校区。2010年经江苏省教育厅提议，南京林业大学和淮安市人民政府共同创建南方学院淮安校区。淮安市是一代伟人周恩来的故乡，市区面积达110平方公里，地处以上海为龙头的长江三角洲地区，是长三角城市群之一，东距黄海海岸线100多公里，京杭大运河与古淮河在淮安交汇，市境内有全国五大淡水湖之一的洪泽湖，已成为全国卫生城市、中国优秀旅游城市、全国环保模范城市、园林城市。淮安人文荟萃，历史上诞生过汉赋大家枚乘、巾帼英雄梁红玉、《西游记》作者吴承恩、民族英雄关天培等。刘少奇、陈毅等许多老一辈革命家也曾在淮安留下光辉的足迹，1986年被国务院评为全国历史文化名城。南方学院淮安校区位于淮安市高等教育园区内，规划占地面积1300多亩，建筑面积30万平方米，已建成500亩校园和7.5万平方米校舍。校区教学设施齐全，生活环境优良，出行交通便捷。

南方学院从校本部抽调有教学经验的教师牵头负责淮安校区教学工作，师资力量雄厚。淮安市高等教育园区内现有淮阴工学院、江苏财经学院、淮安市信息职业技术学院、江苏食品职业技术学院等各类院校9所，文化氛围浓郁。南方学院2010级新生实行2 2办学模式，即一、二学年在淮安校区学习，三、四学年在南京林业大学南方学院本部学习。南方学院设有语言文学系、艺术系、生物与环境科学系、材料与热能工程系、机电工程系、计算机应用工程系、交通与土木工程系、化学工程系、林学系、风景园林系和经济管理系等11个系，设有文、理、工、农、管理、经济、艺术等多个学科门类的30多个在社会就业市场上享有声誉的品牌或特色专业。