1966年5月16日，中共中央政治局通过毛泽东主席主持制订的中共中央通知（即《五一六通知》）。6月4日，县委传达该通知，并成立“文化革命”领导小组。14日、18日，大江中学、启东县中学学生先后贴出大字报，上千学生先后到县委要求开展“文化大革命”运动。7月8日，县直机关开始“文化大革命”运动。8月，运动扩大到全县，县农机厂率先建立“造反组织”。9月，全县各中学停课闹革命，建立“红卫兵”组织，破“四旧”活动不断升级。到年底，全县党组织活动基本停止，各级党政机关大多受到冲击或被“夺权”。
1967年3月31日，启东县军事管制委员会成立。中国人民解放军驻启部队奉命对启东实行军管，介入地方开展“三支”（支左、支工、支农）、“两军”（军管、军训）活动，直至1968年3月启东县革委会成立。