1938年，学校还在校内设附属小学，只招5、6年级学生，1939年底停办。女教师王秋岩的图画特别好，给人留下深刻的印象。

1944年，学校又在“福音堂”开办女子部，招收女生140人，这在当时南阳地区也是少有的，1947年她们有33人毕业，成为赊店解放时非常可贵的女性知识青年，解放后大都参加了革命工作，其中周凤仙、杜哲先、马衣羽等成为县处级领导干部，曾昭梅、李俊英、马霞滨等成了高级技术人员……

1947年，学校又在西阁内街开办高中部。

1945年春，赊镇沦陷，伪军在学校盘据半年，学校被迫停课一学期。汉奸孙正训（维持会长）住在宛东中学院内，学校的图书、仪器损毁殆尽。“8.15”日本投降，赊镇光复，9月份学校复课。学校仍按1942年以来的做法，春、秋两季招生，留级每学期进行，只留一学期，即春班留秋班，秋班留下年春班。

学校有一些理化仪器和理化生标本，勉强可作分组实验，图书室有少量存书，共中“ABC丛书”和“万有文库”是当时利用率最高的书籍。

1945年10月，三青团南阳总部张惠言到宛东中学，建立了三青团组织，此后也没有什么活动。

解放前学校的经费，主要来自学生上交的“学麦”也有地方坤士的少量捐助。

学校的办公室内挂着李毓桂先生的大幅画像，到40年代又挂上了张钫的画像。张钫是二十路军总指挥，率部驻防南阳，曾资助过学校，特邀他为学校名誉校长。

1947年11月，赊镇解放，私立宛东中学停办。校长李承勋和教导主任贾葆恒又回开封分别在两河中学和省立开封高师任教。