孙连仲的父亲孙保安，生长在一个雄县龙湾村[1] 农民家庭，三个儿子中排行第二；幼在私塾读书，稍长，于里中开设面店。其兄与弟皆从事农业。孙保安积得资本后在雄县南关经营钱粮行，生意兴隆，获利颇丰，购置田产四百余亩。孙保安有三个儿子、两个女儿，孙连仲是第二个儿子。孙连仲四岁时，父亲就去世了。此后的生活教育，完全依赖母亲及哥哥的抚养帮助。他的哥哥孙连喜，系清末武秀才，是当地绅士中有影响的人物。弟弟孙连宜，长大后掌管自家的钱粮行，继而早亡。

      孙连仲幼时家里养有骡马，雇有长工。孙上过几年私塾，可是他对读书没有多大兴趣，经常逃学，而最好摆弄牲口，或赶赶大车。以后长得身材高大，膀阔腰圆，颇为强壮。但他既不想继续读书，也不肯务农，因而乡里人给他起了一个诨名，叫他“傻套儿”他身材魁梧，臂力过人。清末民初，社会动盈，青年中颇流行“从军报国”的思想。辛亥革命后的第二年，即1912年2月，北洋军第二镇派孔祥标到雄县招兵。时年十九、并已与同邑苏姓女子结了婚的孙连仲秘密赴招兵处报名应募。其母闻讯，命他的哥哥孙连喜赶至招兵处婉劝，以家道富实，田产年年增加，不但不必去当兵，而且家业尚需他帮助料理为词，要他回家；同时托雄县县长王瑚代为向招兵处交涉除名。孙连仲表示：“男儿应立志报效国家，岂能终老田园与草木同腐?从军之志，不可更改！”其兄为之感动，放弃劝说而归。入伍后，孙连仲被编入第二镇八标二营八连为学兵。清帝退位后，北洋陆军各镇改为师，孙连仲隶王占元的第二师之下。此时孙已调入炮兵营，并由学兵升为正兵。1914年，袁世凯亲信陆建章的京卫军被派往陕西镇压白朗起义军，行军前在各旅成立炮兵营，从他部调选人员，孙连仲被选中，来到了冯玉祥的第十六混成旅炮兵营充任班长。有一次，冯下连检查，适逢孙连仲所在连的连长正在考问士兵“五十二条精神训条”（此为冯玉祥为部队所规定）的内容，就悄悄站在后面听。不料长时间无人主动回答，最后孙连仲站了起来，不仅流利地背诵了一遍，还头头是道地讲解了一番。孙连仲从此为冯玉祥所赏识。