目前，学校占地1311.39亩，建筑面积46万平方米，固定资产8.3亿元，教学仪器及医疗设备总值2.6亿元。图书馆藏书102.8万余册，中外文期刊1553种，创办的《国医论坛》杂志面向国内外公开发行，艾滋病解剖标本全国少有，中药标本馆全国一流，仲景文化特藏馆独具特色，建有千兆校园网和手术直播示教系统。建立了医学形态、医学机能、解剖、细胞与分子生物学、临床医学、中医等6个实验平台及护理、医学影像技术、药学、中医、针灸骨伤、临床等6个专业实训基地，共有各类标准实验实训室316个。护理专业、医学影像技术专业为河南省教改试点专业；中医学专业被确定为河南省高等学校特色专业建设项目；护理、临床医学、针灸推拿、药学专业实训基地为河南省高职高专示范性实训基地建设项目；针灸推拿、医学影像技术专业为河南省特色专业建设项目；《医学影像解剖》、《中医正骨》、《中医骨伤》课程为省级精品课程；中医学教学团队、人体解剖教学团队为河南省高等学校教学团队；中药分析实验室是国家二级科研实验室。

坚持开放办学，加强对外合作。在全国15个省市建立人才就业联络点，并与澳大利亚IBT教育集团签订了联合办学意向，与英国Bell学院合作办学，举办2 1、2 2本科、硕士学历班。与韩国愈村集团中医药研究院、韩国建和药品株式会社、中韩传统医学职业技术学院、新西兰东方医科大学签订了联合办学意向，举办中医学海外班和招收中医留学生班。开辟涉外护理专业学生国外就业途径。毕业生年就业率在85—92%左右。建校以来共为国家输送大中专毕业生3万余人，为南阳经济社会发展做出了贡献。

学校先后荣获“全国五四红旗团委”、“全国卫生文明先进集体”、“河南省先进基层党组织”、“河南省文明单位”、“河南省文明学校”、“河南省教育先进单位”、“河南省治安模范单位”、“河南省普通大中专毕业生就业工作先进集体”、“河南省大学生社会实践先进集体”和“河南省十大品牌学校”等荣誉称号。在2008年教育部人才培养工作水平评估中获得优秀等次。

南阳医学高等专科学校的前身是创办于1951年的南阳卫校，2004年经国家教育部批准升格。2006年南阳市委、市政府对南阳医学教育资源进行整合，委托南阳医学高等专科学校对南阳中医药学校、南阳理工学院国医国药系（原张仲景国医大学）、南阳市一职专实行“五统一”代管，形成了以西医为主体、中医为特色、中西合璧、优势互补的办学格局。