解放前，长泰县没有专门的防空机构，县境内的防空事宜由县警察局兼管。中华人民共和国成立后，1950年由县军管会、县政府和县公安局人员组成县防空委员会，防空工作由县公安局兼管。1959年9月，县成立人民防空领导小组，开展防空工作。1969年，根据中共中央、中央军委关于成立人民防空领导小组的指示，县成立了人民防空领导小组，县革委会主任为组长，1983年11月恢复为人民防空委员会。1991年起，为应对台海形势和局部战争的需要，人防工作逐步加强，县于1998年成立长泰县人民防空办公室，由县建设局一名副局长兼任主任。2003年，市人防办根据市政府有关通知精神，授予县建设局人防行政管理权。

2005年1月，县委、县政府调整县国动委及其办事机构，县人防办主任由县政府办一名副主任兼，县建设局一名副局长兼任副主任。2006年1月，根据漳编（2006）1号文件精神，县设立人民防空办公室，挂靠县政府办，主任由政府办一名副主任兼任，因机构设置问题未根本解决，县建设局仍履行人防部门的部分职责。

2009年5月，中共长泰县委机构编制委员会发文，成立长泰县国防动员委员会人民防空办公室，县人防办作为国动委常设机构和县政府人民防空的工作的主管部门，负责全县人防工作的管理。