建国前夕，全区仅有西医200余人，中医850余人，医疗设施非常简陋，当时规模最大的省立上饶医院，也仅有病床30张，县立卫生院病床充其量也才3-5张。建国后，上饶地区大力增设卫生医疗机构，积极培养卫生医务人员，逐年扩充医疗设施，不断改善医务人员的工作条件。
进入21世纪，上饶市卫生事业加快发展，市人民医院创“三甲”医院获得成功，甲型H1N1流感等传染病防控工作取得阶段性胜利。“光明微笑”工程有效推进，17760例白内障患者重见光明，858名唇腭裂患者露出微笑。食品药品专项整治扎实开展，上饶市未发生重大食品药品安全事件。共有卫生机构9183个。其中，医院113个，卫生院240个。医疗卫生机构共有床位19764张，其中医院12635张。平均每千人拥有医院床位1.7张。全市卫生技术人员达到24381人，增长19.9%。其中执业医师9492人，注册护士9568人。平均每千人拥有执业医师1.28人，平均每千人拥有注册护士1.29人。全市医疗机构共诊疗3439万人次，健康检查161万人次。