近年来，文山县对盘龙河水流域进行综合治理，通过植被恢复保护工程、盘龙河水源地保护工程、盘龙河流域污染源专项治理工程、城镇环境基础设施工程、启动实施城区段盘龙河综合治理工程五大工程治理盘龙河，目前，该河水质良好，枯水期水质达Ⅳ类标准，丰水期水质达Ⅲ类标准。

盘龙河流经云南省文山州的文山、西畴、马关三县，于船头出境流入越南，在文山县境内流程104公里，是该县生产生活的重要水源，该县2976.12平方公里国土面积、43万人的基本生产、生活、工业、农业用水都靠盘龙河水系供给。近年来，由于严重的乱砍乱伐，致使盘龙河水土流失不断加剧，建国以来至1998年期间的实测年平均输沙量是五十年代前年平均的3倍多，最大断面平均含沙量是五十年代前的8.9倍，严重的水土流失，导致盘龙河在雨季出现黄流浊浪现象。

在盘龙河流域综合治理及植被恢复保护过程中,经过几年来的不懈努力，文山县共完成治理水土流失面积38.767平方公里，占下达计划37平方公里的104.81%，其中：坡改梯6869亩，水保林19068亩，经济林果12290亩，封禁治理10779亩，保土耕作9125亩。完成小型水利水保工程94处，其中：拦砂坝31座、水池63个，发放种植树苗563.13万株。从“九五”以来，全县人造林38.5万亩，封山育林48万亩，全民义务植树1150万株，有林地面积、活立木蓄积稳步增长，分别达到5.88万公顷和441.41万立方米，森林覆盖率从1983年的19.2%提高到2006年的36.7%。老君山保护区是盘龙河水源的主要发源地，为加大保护力度，全面结合整顿和规范矿产资源开发秩序专项行动，文山县成立了以分管副县长为组长，国土、安监、环保、森林公安等部门领导为成员的综合整治领导小组，对老君山保护区周边村寨等地的非法探矿、采选矿、破坏森林资源等进行多次整治。近两年来，先后共开展综合治理11次，出动综合执法2900多人次，严厉打击了肆意破坏老君山自然保护区的非法行为。通过综合整治，周边群众生态环境保护意识得到提高，私挖滥采乱选矿、破坏森林资源的违法行为得到有效遏制。

随着经济的不断发展，工业项目逐年增加，对盘龙河造成了一定的威胁，为了保护全县的饮用水源的安全，文山县对盘龙河流域的工业企业进行了治理和取缔，共对辖区内老君山周边及盘龙河沿岸影响饮用水安全的14个污染源进行了综合整治，关闭了老回龙铁选厂等5个企业，对老回龙摆衣寨砒霜厂实施了搬迁。并加强对盘龙河上游污染企业的现场环境监察，实行定人定责。还对盘龙河流域采沙、捞沙行为进行了专项治理，治理中共扣留机动捞沙船29艘、柴油机12台、吸沙泵14台。制定了采沙管理制度，栽种树苗11000株，有效地打击了私挖乱采的行为，规范了采沙秩序，保护了盘龙河周边的生态环境。

城镇的生活垃圾造成了对盘龙河的二次污染，2003年投资兴建的文山城市生活垃圾处理场,采用卫生式填埋处理工艺，日处理垃圾150吨，较好地解决了垃圾污染问题。同时，针对城区生产、生活污水直排对盘龙河造成污染的问题，投资了6284.5万元建成日处理2.5万吨的文山县污水处理厂，现已经进入了试运行阶段。并对盘龙河上游的7个乡镇加大了资金投入和监管力度，完善环境基础设施。为了解决城区居民生活、生产污水对盘龙河造成的污染，从2004年底开始，实施了盘龙河城区段综合治理工程，治理河道全长28.5公里，实施河道清淤约9公里，清除河道淤泥20万立方米，修建部分河堤、挡墙400米，沿盘龙河老城区两岸安装截污管道5080米，修建沿河绿化带、花台、装饰绿地面积共8000多平方米，并对已经塌方的河堤进行了重建。