全称 “永明华藏寺”，位于峨眉山金顶顶峰，海拔高度3077米，与“金顶寺院”合二为一，统称华藏寺，其意各有所表。该寺其历史沿革缘起普贤显相的“蒲公追鹿”和奉汉明帝旨建之传，创建于公元一世纪，应为峨眉山最早寺院之一。汉唐时的普光殿、光相寺、祖殿（开山祖殿）等，规模须小，也可凭为山中最早建寺依据。史载：明洪武初（约1377）国师宝昙奉旨来山重修寺院，时仅板屋一椽，因山高风大，总兵祁三春捐资，遂将之覆为铁瓦，俗称铁瓦殿，后被火焚。明代万历辛丑二十九年（1601），妙峰（山西五台山僧）、惟密禅师来峨礼普贤，发愿铸三大士渗金像以铜殿覆之，即募西蜀藩王等，得黄金数千两，送往湖北荆州监制。明万历壬寅（1602），先后铸造铜殿三处：一在峨眉山，一在五台山，一在普陀山。明万历乙卯（1615）秋天运至峨眉组装，在大峨山铁瓦殿后的最高处，做成了普贤愿王铜殿，铜殿通高二丈五尺，宽一丈四尺四，进深一丈三尺五。铜殿上部为重檐雕甍，环以绣棂琐窗，殿中祀大士铜像，傍绕万佛，门枋空处雕画，云栈剑阁之险，顶部通体贴金，巍峨浩漾，迢耀天地，故称“金殿”或曰“金顶”，明神宗朱翊钧御题横额“永明华藏寺”。清光绪十六年（1890）该殿毁，光绪十八年（1892）寺僧心启、月照和尚新建砖木构造殿堂，铜碑、铜门、普贤铜像等法器置其中，殿脊之上置以渗金宝顶，仍不失“金顶”之庄严。寺东面的悬崖壁下，每当云雾相交，会出现奇妙的金顶祥光，即峨眉宝光（佛光）。“金顶祥光” 被清代文人谭钟岳誉为“峨眉十景” 之一。
民国12年和20年（1923、1931）又两次失火再建。1972年4月华藏寺又再遭火毁。寺虽屡遭祸殃，但因名震诸山，1983年仍被国家列入首批全国重点汉传寺院。1986年人民政府和峨眉山佛教协会，共同出资重建金顶华藏寺，1989年落成，1990年9月11日举行了开光法会。
为恢复和庄严千座名山一座顶，把金顶华藏寺建成世界上著名的朝圣中心，2002年在人民政府的关怀和相关部门的支持下，峨眉山两序大众勤俭集巨资，规划了重新“恢复华藏寺改造工程”，并根据《普贤行愿品》十大愿含义，拟建高48米的“十方普贤”圣像方案。佛教的根本问题是明心见性之开悟，“十方普贤”是人间佛教的具体表现。该工程历经4年，举世瞩目，千秋功德，已于2006年6月圆满。同年6月18日举行了盛大的“金顶华藏寺改造落成庆典”暨“十方普贤圣像开光法会”，海内外108位高僧大德、诸山长老、特邀嘉宾以及数千名信众缘聚华藏寺，“天下峨眉、云上金顶”。