1943年4月，三八六旅和决死纵队第一旅进行干部调整，杨世荣被调到决死纵队工作，最初担任决死一旅组织科副科长，后调任决死一旅二十五团政治处主任。这时，日寇以“铁滚大扫荡”战术向我边区进攻，施行“三光政策”，大肆抢粮、毁粮，妄图断绝我根据地军民的生路。我军一方面要打仗，另一方面又要搞生产，以减轻人民的负担。面对险恶的环境和艰巨的任务，杨世荣十分重视抓好政治思想工作，注意发扬民主，并以自身的模范行动来影响带动全团干部战士。

1944年，阎锡山与日寇勾结，并在日军的配合下大举向我太岳地区进犯。太岳军区决定进行坚决反击。6月12日，二十五团和三十八团奔袭全歼日伪军一个团直机关及两个营。9月，为巩固和发展抗日根据地，太岳军区决定集中兵力发动第二次青（城）浮（山）战役，以消灭阎锡山的六十一军主力七十二师。我二十二团、三十八团和洪赵支队联合组成左纵队，首先攻歼驻守徐家安子的敌七十二师二一五团。战斗中，杨世荣把政治工作做到前沿，把政治鼓动带到阵地。阎军虽然利用坚固工事进行顽抗，使我参战部队伤亡很大，所剩不足2个连。但由于他们平时养成了勇猛顽强的战斗作风，终于同其他兄弟部队一起，攻克徐家安子，全歼了守敌。

抗日战争胜利后，杨世荣被调到晋冀鲁豫野战军第四纵队十一旅三十三团任政委。1946年1月，他进入晋冀鲁豫中央局党校学习。

1946年7月，胡宗南和阎锡山联合进犯晋南解放区，被我太岳部队击退。8月，我军发动晋南战役，向驻扎在同蒲路上临汾至灵石一线的蒋军发动攻势，先后解放了洪洞、赵城、霍县、灵石、汾石、豫城等地。在攻打洪洞县的战斗中，杨世荣带领突击队猛打猛冲，指挥部队攻进县城。在激烈的枪林弹雨中，他右腿负伤。由于当时医疗条件所限，这粒子弹在他身上成了永久的纪念，伴随他度过了以后的41年。