商水县位于河南省东南部，东临项城，南与驻马店上蔡接壤，东经114°15′-114°53′、北纬33°18′-33°45′之间，县域东西长60公里，南北宽25公里。

商水县地势平坦，西北高东南低。

地处暖温带南部，属亚热带向暖温带过渡区，为季风半湿润气候，全年温度适宜，四季分明。年日照时数平均2094.9小时，年平均降水量785.1mm，无霜期历年平均为223天，年平均气温14.5℃。1月份到2月份最冷，平均气温0.2℃；7月份到8月份最热，平均气温27.5℃。

商水县河流纵横，沙颍河、汾河、清水河等顺势流过，浅层地下水充足，约为2.315亿立方米。富水区415.63平方公里，占总土地面积的31.8%；中等水量区626.26平方公里，占总土地面积的47.9%；小水量区264.96平方公里，占总土地面积的20.3%。