学校原校址位于现高邮市赞化学校，占地4.26万平方米（约64亩）。由于不能适应学校发展的需要，2000年，经高邮市人民政府批准，学校易地新建，2001年8月，学校实现整体搬迁。新校园占地14.92万平方米（约224亩），建筑面积68800多平方米。

2002年与澳大利亚汉密尔顿·亚历山德拉学院结为姊妹学校，2004年又被江苏省教育厅授予首批“江苏省四星级普通高中”。2005年经江苏省教育厅批准，学校正式更名为“江苏省高邮中学”。

2013年10月，高邮中学“物理课程基地”以排名第二的成绩被省教育厅确定为2013年普通高中课程基地建设项目。

.教学建设 折叠 编辑本段 .高邮中学是一所传统风格与现代意识相融汇、教育功能与管理功能相统一、建筑共性与学校个性相结合的现代化、园林式学校。

师资力量 折叠通过“青蓝工程”、“明星工程”、“群星工程”的实施，教师的师德修养、业务水平有了很大提高。学校先后涌现出一大批知名教师，在校内外、市内外、省内外产生了广泛影响。高邮中学有全国优秀教师1名，省特级教师3名，省特级教师培养对象2名，省市级劳动模范、中青年专家、优秀教师和学科带头人20多名，中、高级职称教师140多名。高邮中学有全国模范教师、全国优秀教师各1名，特级教师5名，省市级劳动模范、中青年专家、优秀教师和学科带头人20多名。学校青年教师参加省、市级优质课、优质教案等比赛获奖众多，有一大批青年教师在教科研、教学竞赛中脱颖而出，他们以优良的素质、勤奋的工作和优异的实绩，赢得了学生的爱戴、家长的信任和社会的尊重，也为学校的进一步发展注入了生机和活力。