吉安境内河流众多，以赣江为中轴，有28条大小支流汇入，各河上游植被茂密，山高水陡，水量充盈，水力资源充沛。各河水流域总面积约29000平方公里，水资源总量为196.75亿立方米。理论蕴藏量为2503千瓦，可开发利用的水能资源为157万千瓦。赣江从万安良口经泰和、吉安、吉水、峡江流至新干三湖，过境河长289公里，占赣江总长的35.2%。其中集中面积在1000平方公里以上的赣江一级支流有遂川、蜀水、孤江、禾水、泸水、乌江、洲湖河及牛吼江共8条，总流域面积为22500平方公里，集中面积在200-1000平方公里的赣江一级支流良口水、皂口水、通津水、云亭水、仙搓水、固陂水、横石水、固江、黄金水、住岐水、沂江、湄湘水、狗颈水等十三条河流总长约28000公里，沙网密度为0.8公里/平方公里；全市现有水库1206座，蓄水量达19亿立方米。地表水人均占有量约为4800立方米，亩均耕地占有量为3460立方米。地下水埋深3-5米，含水层厚8-15米，多年平均地下水总量为46亿立方米，丰水年为56亿立方米，平水年为45亿立方米，枯水年为28亿立方米。

     吉安市地下矿藏众多，主要有煤、铁、钨、钼、镍、铌、钽、铍、砂金、耐火粘土、泥炭、锰、钾、稀土、白泥、荧石、花岗石、大理石、粉石英等50多种。有开采价值的矿点400多处。还有金、银、铀、钴、锡、铂、重晶石、温泉等矿种。钨矿储量仅次于赣南位居全省第二。花岗岩资源颇为丰富，且结构均匀、质地坚实、品种多样、花色有桃红、赤红、墨绿玉、墨玉、翡翠玉等17种，储量9亿多立方米。大理石储量达2亿立方米，矿体裸露、矿石纯净细腻，晶莹如玉，质润坚韧，经火耐磨，颜色有白、红、青、绿、黑数种。荧石、陶玉、瓷土、岩盐矿、钾盐矿、石膏等矿，品位高、杂质少、储量均在5000万吨以上。泥碳资源是吉安一大优势矿种，是一个有开采价值的矿种。