和ERP的人力资源管理不同，物流系统所赋予人力资源管理主要是针对作业人员的管理。它包括了人员属性记录，工作经验记录以及岗位经验记录和奖惩记录。在我国物流企业中，除了管理人员以外，大多数作业人员来源于劳务市场和外来打工人员，这些人员流动性较大，且劳务市场对这些人员的管理水平较低，因此物流管理系统必须提供基于物流运作需求的人力资源管理，建立人力资源数据库。

人力资源流动性大带来的结果之一就是无法稳定地提高作业规范化水平，无法长期培训，使劳务人员逐步成长为专业操作人员。因此，必须通过人力资源数据库对所有参加过本企业工作的人员加以记录，方式记录。形成基于本企业需求的劳务市场(Labor Pool)，从而使基于本企业的劳动力技能得到继承和提高。

另外，还需要设计人员的KPI表和月度/季度/年度/业绩评估表，从而能够全面地评价作业人员的状况。

另外，必须以投资的眼光看待人力资源，引进一批作业人员，就要开始核算在这些人员上的投入，包括工资、税费以及保险等，同时还要通过KPI来评估其产出，人力资源是最有潜力可挖的。