牡丹江医学院有教职工2600人，其中教师1525人，专任教师580人，博士88人，其中留学归国博士7人，硕士550人。有兼职博士研究生导师3人、其中具有副高级以上职称600多人，有龙江学者特聘教授1人，省级教学名师1人，省级教学团队2个，博士生导师5人，硕士生导师72人，全省卫生系统有突出贡献中青年专家17人，牡丹江市优秀中青年专家8人。聘请美国著名医学专家葛仁山教授来校工作，聘任共享院士2人、长江学者1人、客座教授19人。享受国家级、省级政府特殊津贴者9人。

学院设有“抗纤维化生物治疗”实验室是黑龙江省重点实验室，“麻醉与危重病学”实验室是与哈尔滨医科大学协作的黑龙江省重点实验室，“组织损伤与修复”实验室、“肿瘤疾病防治”实验室是黑龙江省高校重点实验室。“生物化学与分子生物学实验室”、“生物学实验室”、“药学实验室”是中央与地方共建高校基础实验室。学院设有省级生物医药技术服务平台、校企共建工程技术研发中心和牡丹江市北药开发实验基地。学院还被列为全省特色应用型本科院校建设单位。