夏商时期，境内置小诸侯国（今鹿邑县太清宫镇）始称“厉（Lài）”，属豫州。此乃鹿邑县有史记载的设城建置之始，距今已有4000余年。此设置一直延续至西周。 　　公元前770年，周平王迁都洛邑，历史进入春秋战国时期，境内置苦（hù）（今鹿邑县太清宫镇），一度名相和鸣鹿（今鹿邑县辛集镇），均属豫州陈国。公 元前 571年，著名的思想家、政治家、哲学家、道家鼻祖老子李耳（老聃）就诞生在苦赖乡曲仁里（今鹿邑县太清宫镇）。周敬王42年7月（前478年），楚惠王 灭陈，苦又属楚。秦时，苦县属豫州陈国。 　　西汉，苦县属兖州淮阳国。新莽时期改苦为赖陵，建武元年（公元25年）光武帝改赖陵复苦县。建安元年（公元196年）献帝封曹操为武平侯，食邑于此，属豫州陈国。现鹿邑县境内还存有三国魏曹修建的武平城（今鹿邑县邱集乡武平城村）及观武台（今鹿邑县玄武镇）遗址。 　　晋咸康三年（公元337年），改苦为父阳（今鹿邑县太清宫）和武平属陈留郡。南北朝孝明帝正光年间改父阳为谷阳，属陈留郡。

隋，谷阳属豫州谯郡。开皇十六年（公元596年）更武平为鹿邑，并移治今试量镇鹿邑属淮阳郡。大业十三年（公元617年）农民军田黑社占据鹿邑，改鹿邑为涡州。唐，武德三年（公元620年）田黑社败，更涡州复名鹿邑。 　　李唐时期，唐王朝认老子李耳为先祖，追封为乾元皇帝。并在老子出生地兴建观庙和行宫（即太清宫、洞霄宫），作为每年朝廷祭祀老子之用。又将老子生地（今 鹿邑县太清宫）追封为道德真源、天尊仙源。所以，乾封元年（公元666年）改谷阳为真源，载初元年（公元689年）改真源为仙源。神龙元年（公元705 年）仙源复名为真源，同属河南道亳州。 　　宋，大中祥符七年（公元1014年）改真源为卫真和鹿邑同属淮南东路亳州辖。　元，至元二年（公元1265年），鹿邑、卫真两县合并，取名鹿邑，治所设置在今县城，属河南江北行省归德府亳州。从此，县名始一，境域至清末亦无大变化。 　　明清时期，鹿邑均隶属河南归德。民国时期先后属开封、商丘、淮阳等专区。中华人民共和国成立后，鹿邑县的行政隶属关系和行政区划设置，有过几次较大的变动和调整。 　　建国初期，鹿邑县先后属淮阳、商丘、开封、周口等专区。1968年6月属周口地区。2000年6月至今，国务院批准周口撤地设，鹿邑从之。