1956年6月，随着农业合作化运动的迅速开展，全县社会经济有了很大开展，社会治安日趋巩固，将原16个区、219个乡、镇，调整为9个区、95个乡镇，各区直接以区所在地命名、即英都区、美林区、诗山区、梅山区、洪濑区、丰州区、官桥区、石井区、大嶝区。
1958年2月开始，开展工农业生产大跃进运动，全县进一步精简机构，即撤区并乡，除保留大嶝区外，其它8个区级机构全部取消，并将原有的95个乡镇，合并为36个乡，镇。即溪美镇、山头镇、码头镇、洪濑镇、丰州镇、官桥镇、水头镇、莲塘乡、南金乡、玉叶乡、大宇乡、榕桥乡、英都乡、东田乡、坪峰乡、翔云乡、烟山乡、蓬华乡、高盖乡、金淘乡、后坑乡、眉山乡、梅山乡、罗东乡、乐峰乡、九都乡、鹏山乡、八都乡、都心乡、康美镇、五都乡、幸福乡、黄山乡、大盈乡、成功乡、胜利乡。
1958年10月，随着人民公社化高潮的到来，在城关、英都、诗山、梅山、洪濑、丰州、官桥、石井等地分别成立卫星人民公社、红旗人民公社、五星人民公社、火箭人民公社、红色人民公社、灯塔人民公社、红专人民公社、成功人民公社。年底，又以各公社所在地命名，并从石井公社划出大嶝、小嶝、成立大嶝公社，共设222个生产大队，实现了政社合一。
1958年人民公社化期间，把本县原丰州招贤点的糖房、潘山、西埔、烧厝、京塘，岐山点的新浦、黄龙、坂头、岐山、东边、黄石头、金浦、大锦田、华岩、浮桥街头划归泉州市管辖。
1959年6月，县整社工作开始。从英都人民公社分出东田人民公社，从诗山人民公社分出金淘人民公社和码头人民公社，从梅山人民公社分出九都人民公社，从洪濑人民公社分出康美人民公社。到1959年年底，全县共成立14个人民公社，286个生产队，3086个生产小队。
1961年8月，恢复区公所基层建制，全县把14个公社改为11个区公所。即城关区、东田区、英都区、金淘区、诗山区、梅山区、九都区、洪濑区、丰州区、官桥区、石井区。以及大嶝人民公社管理委员会。区公所下辖65个公社。