90年代以来，学校建设高质量、有特色、现代化一流中学事业迅速发展，先后获得了“全国中学实践教育活动先进学校”、“福建省文明学校”、“泉州市中学素质教育先进学校”等50多项地市级以上荣誉称号以及南安市中学田径运动会、南安市中学生篮球赛、南安市中学生足球赛上屡夺佳绩，《中国教育报》、《福建省电视台》、《泉州电视台》等媒体多次专题报道学校的先进经验。目前，学校高考、中考成绩稳居南安市完中前列，并已获准免于参加全省高中会考。

新的世纪中，南安华侨中学将面临更多的机遇和挑战，学校全体师生将以“三个代表”重要思想为指导，与时俱进，开拓创新，向着国家级示范性高中的奋斗目标大步迈进。

学校于1960年设立高中部，成为完全中学。建校48年来，已培养了2万多名高、初中毕业生，有着较为丰富的办学经验。九十年代以来，学校致力于中考、高考改革的研究，逐渐摸索出一套行之有效的初、高中毕业班工作模式，学校毕业班教育教学工作年年取得新的突破，几年来，学校高考成绩稳居南安市完中前列，上线率均达90%以上，有多名同学考上清华、北大、科大、人大等全国一流大学，并两度夺得南安市高考文科状元。