新疆兵团军垦博物馆的前身是1988年筹建的石河子军垦博物馆。1995年开馆至今，已接待中外游客30万人次以上，是全国第一家反映军垦历史的博物馆。

     1995年9月至2004年10月，馆址设在原二十二兵团领导创业旧址内，陈展面积仅168平方米。

      2004年在石河子军垦博物馆的基础上，将石河子市市级文物保护单位“军恳第一楼”改扩建成为“新疆兵团军垦博物馆”，于2004年10月10日新疆生产建设兵团成立五十周年之际开馆并举行了隆重的揭牌仪式。

　   新疆兵团军垦博物馆总建筑面积9703平方米，目前展出的物品有5000多件，其中有29件属国家一级革命文物。采用声、光、电效果，再现进疆人民解放军向荒原开战的大型半景画，给人们留下深刻的印象。2005年被评为全国百个红色旅游景点之一。

改扩建的新疆兵团军垦博物馆陈列面积3100平方米，集展览、会议、办公为一体，功能齐全。它是全国唯一的一座以新中国新疆屯垦戍边史为主要陈列内容的博物馆。